Swift anuncia el método de preparación de bibliotecas con secuenciación para metilación de una sola célula más novedoso
ANN ARBOR, Michigan, 11 de agosto de 2017 /PRNewswire/ -- Swift Biosciences, uno de los más destacados proveedores de soluciones innovadoras de preparación de bibliotecas para secuenciación de última generación (SUG), ha anunciado hoy la presentación de un método nuevo de secuenciación para metilación de una sola célula basado en su tecnología Accel-NGS® Adaptase™, el cual constituye una solución sólida y eficaz de preparación de SUG para secuenciar todo el genoma por bisulfito en resolución de una sola célula. Este método que ahora se presenta permite analizar con eficacia distintas regiones metiladas de miles de células de tejidos heterogéneos, al tiempo que facilita una serie de aplicaciones, como la clasificación de células, la regulación de los mecanismos celulares en tejidos normales, las alteraciones epigenéticas en estados de enfermedad y la conservación evolutiva de la regulación epigenómica.
La metilación constituye un tipo estable de biomarcador que puede emplearse para identificar las clases de células y los elementos reguladores que subyacen a la función celular. Cuando se acompaña de estudios de expresión del ARN en una única célula, la metilación de una sola célula puede servir para dilucidar cuáles son los elementos reguladores que, a su vez, controlan los perfiles singulares de expresión de cada célula y las diferencias existentes entre estas. Además, existen algunos estudios clínicos recientes que han revelado la presencia de patrones de metilación en una serie de enfermedades —como el cáncer— mediante los que se detecta el tipo de tumor, se evalúa la carga tumoral en biopsias líquidas y se establece una correlación con el curso de la enfermedad, su pronóstico y la respuesta a los fármacos.
Este método se ha sido descrito recientemente en un artículo de Science titulado "Single Cell Methylomes Identify Neuronal Subtypes and Regulatory Elements in Mammalian Cortex" (Identificación, mediante metilomas de una sola célula, de subtipos neuronales y elementos reguladores ubicados en la corteza de los mamíferos) por colaboradores del Instituto Salk, la Universidad de California en San Diego y Swift Biosciences. En este procedimiento de trabajo se combinan el aislamiento basado en la clasificación de células activadas por fluorescencia, la conversión por bisulfito y el módulo Accel-NGS Adaptase de Swift con otros componentes disponibles en el mercado. A la vista del resultado publicado, se demuestra un aumento de más del doble en las tasas cartográficas con respecto a otros métodos y, por lo tanto, se mejora considerablemente la obtención de datos por cada proceso de secuenciación, a la vez que se reduce el coste general.
"Este es uno de los muchos ejemplos de colaboración científica en los que las tecnologías de Swift llevan la ciencia al límite", señaló Timothy Harkins, presidente y consejero delegado de Swift Biosciences y coautor del artículo. "Nos llenan de entusiasmo los descubrimientos que prevemos hacer con respecto a los procesos celulares básicos y las hondas consecuencias que en el futuro van a tener en la medicina de precisión".
"Nuestra tecnología patentada Adaptase permite construir bibliotecas de SUG de alta complejidad a partir de ADN monocatenario con aportes bajos", afirmó la doctora Laurie Kurihara, directora principal de Investigación y Desarrollo y coautora del artículo. "El procedimiento de trabajo que empleamos para la secuenciación de una sola célula contiene menos etapas que otros métodos y ofrece procesamiento múltiple de una sola célula para brindar una mayor productividad en aplicaciones de alto rendimiento".
El módulo Accel-NGS Adaptase ya está disponible en el mercado.
